ゲーム中にはヒューマン（人間）・ニューマン（人造人間？）・アンドロイドの３種族が登場する。また、職業にはハンター（接近戦主体）・レンジャー（遠距離戦主体）・フォース（テクニック主体）の３種類がある。この組み合わせおよび男女の別でキャラクターを選べる……ということで、計１６種類（アンドロイドはテクニックを使えないのでフォース不可）のキャラクターが登場……だとよかったのだが、これだけのモデルを用意するのが大変だったためか、DC版・PC版では９種類だけ登場した。
GC版「エピソード１＆２」からは３種類が追加。しかし、未だヒューマンの女性ハンターやニューマンのレンジャーはおらず、登場が待たれる。
なお、同じキャラクターでも髪型・顔つき・服装・色・体型など、かなり細かく設定できるので、バリエーションは無限だとも云える。GC版以降は特に服装等のバリエーションが非常に増えている。
登場するキャラクターは以下の通り。
| ヒューマン | ニューマン | アンドロイド | ||||
| 男 | 女 | 男 | 女 | 男 | 女 | |
| ハンター | ヒューマー | − | − | ハニュエール | ヒューキャスト | ヒューキャシール |
| レンジャー | レイマー | レイマール | − | − | レイキャスト | レイキャシール |
| フォース | フォーマー | フォマール | フォニューム | フォニュエール | − | − |
※赤字はGC版・Xbox版のみ。
※ヒューマンはバランス型、ニューマンはテクニックに長けるが肉弾戦に弱い、アンドロイドは頑丈だがテクニックが使用不可、という特徴がある。
ハンターズに支給される防具の一種……という設定だが、云ってみればペットのようなもの。アイテムを与えると成長し、姿形を変える。成長するとキャラクターの能力を補強してくれるが、むしろ特殊行動や見た目で選ばれることが多い。
キャラクターの能力と職業、セクションID（キャラクターの名前から決まる）によって成長経路が変わるので、好みのマグを手に入れるのは一苦労。また、GC版以降、一定時間が経過するとシンクロ率が下がるようになったので、他のキャラでレベル200のマグを作って、それをそのままキープする、というのは、事実上不可能だと云っていい。
特殊な条件で変化する「レアマグ」も多数存在する。レアマグは一度変化したら、その後、別の条件を満たしても変化しないので、多くのプレイヤーはこのレアマグを所持している。